如何安装配置RStudio Server?

R Project

1 基础知识

1.1 RStudio的介绍

RStudio是R编程语言集成开发环境(IDE)

1.2 RStudio的特点

RStudio支持定制工作台,包含R所需的所有工具(控制台、源代码、绘图、工作区、帮助、历史记录等)
RStudio支持语法高亮显示
RStudio支持直接从源代码编辑器执行代码
RStudio支持Windows、MAC和Linux平台
Rstudio支持服务器端运行,允许多个用户通过Web浏览器访问IDE环境(RStudio Server)

2 最佳实践

2.1 环境配置

2.1.1 系统环境配置

OS = CentOS 8.x x86_64
Host Name = rstudio.cmdschool.org
IP Address = 10.168.0.68

2.1.2 关闭SELinux

sed -i 's/SELINUX=enforcing/SELINUX=disabled/g' /etc/selinux/config
setenforce 0

2.2 安装R

2.2.1 下载指定版本的安装包

export R_VERSION=4.1.2
curl -O https://cdn.rstudio.com/r/centos-8/pkgs/R-${R_VERSION}-1-1.x86_64.rpm

2.2.2 安装R包

yum install R-${R_VERSION}-1-1.x86_64.rpm

2.2.3 设置环境变量

export R_VERSION=4.1.2
ln -s /opt/R/${R_VERSION}/bin/R /usr/local/bin/R
ln -s /opt/R/${R_VERSION}/bin/Rscript /usr/local/bin/Rscript

设置完毕后,可使用如下命令确认设置,

R --version

2.4 安装R Server

2.4.1 下载R Server包

wget https://download2.rstudio.org/server/centos8/x86_64/rstudio-server-rhel-2021.09.1-372-x86_64.rpm

2.4.2 安装R Server包

yum install rstudio-server-rhel-2021.09.1-372-x86_64.rpm

2.4.3 启动服务器并设置自启动

systemctl start rstudio-server.service
systemctl restart rstudio-server.service
systemctl status rstudio-server.service
systemctl enable rstudio-server.service

服务启动后,可使用如下命令查确认服务运行,

netstat -antp | grep rserver

可见如下显示,

tcp        0      0 0.0.0.0:8787            0.0.0.0:*               LISTEN      406/rserver

2.4.4 开放防火墙端口

firewall-cmd --permanent --add-port 8787/tcp
firewall-cmd --reload
firewall-cmd --list-all

2.4.5 设置用户

useradd user01
echo userpwd | passwd --stdin user01

2.4.6 测试服务

http://10.168.0.68:8787

user name: user01
user password: userpwd

2.5 环境变量定义

2.5.1 查看环境变量

Sys.getenv()

登录之后可在IDE的“Console”里面执行,可见如下显示,

> Sys.getenv()
CLICOLOR_FORCE              1
DISPLAY                     :0
EDITOR                      vi
GIT_ASKPASS                 rpostback-askpass
HOME                        /home/user01
LANG                        en_US.UTF-8
LD_LIBRARY_PATH             /opt/R/4.1.2/lib/R/lib:/lib:/usr/local/lib
LN_S                        ln -s
LOGNAME                     user01
MAKE                        make
MPLENGINE                   tkAgg
NLSPATH                     /usr/dt/lib/nls/msg/%L/%N.cat
PAGER                       /usr/bin/less
PATH                        /usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/usr/lib/rstudio-server/bin/postback
R_BROWSER                   xdg-open
R_BZIPCMD                   /usr/bin/bzip2
R_DOC_DIR                   /opt/R/4.1.2/lib/R/doc
R_GZIPCMD                   /usr/bin/gzip
R_HOME                      /opt/R/4.1.2/lib/R
R_INCLUDE_DIR               /opt/R/4.1.2/lib/R/include
R_LIBS_SITE                 
R_LIBS_USER                 ~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1
R_PAPERSIZE                 letter
R_PDFVIEWER                 /usr/bin/open
R_PLATFORM                  x86_64-pc-linux-gnu
R_PRINTCMD                  /usr/bin/lpr
R_RD4PDF                    times,hyper
R_SESSION_TMPDIR            /tmp/RtmpLjT9Kx
R_SHARE_DIR                 /opt/R/4.1.2/lib/R/share
R_STRIP_SHARED_LIB          strip --strip-unneeded
R_STRIP_STATIC_LIB          strip --strip-debug
R_SYSTEM_ABI                linux,gcc,gxx,gfortran,gfortran
R_TEXI2DVICMD               /usr/bin/texi2dvi
R_UNZIPCMD                  /usr/bin/unzip
R_ZIPCMD                    /usr/bin/zip
RMARKDOWN_MATHJAX_PATH      /usr/lib/rstudio-server/resources/mathjax-27
RS_RPOSTBACK_PATH           /usr/lib/rstudio-server/bin/rpostback
RS_SESSION_TMP_DIR          /var/run/rstudio-server/rstudio-rsession
RSTUDIO                     1
RSTUDIO_CONSOLE_COLOR       256
RSTUDIO_CONSOLE_WIDTH       96
RSTUDIO_HTTP_REFERER        http://rstudio.cmdschool.org:8787/
RSTUDIO_PANDOC              /usr/lib/rstudio-server/bin/pandoc
RSTUDIO_PROGRAM_MODE        server
RSTUDIO_R_MODULE            
RSTUDIO_R_PRELAUNCH_SCRIPT
                            
RSTUDIO_R_REPO              
RSTUDIO_R_VERSION_LABEL     
RSTUDIO_SESSION_STREAM      user01-d
RSTUDIO_USER_IDENTITY       user01
RSTUDIO_USER_IDENTITY_DISPLAY
                            user01
RSTUDIO_WINUTILS            bin/winutils
SED                         /usr/bin/sed
SSH_ASKPASS                 rpostback-askpass
TAR                         /usr/bin/gtar
TERM                        xterm-256color
USER                        user01
XFILESEARCHPATH             /usr/dt/app-defaults/%L/Dt

如果需要修改“R_HOM”和“LD_LIBRARY_PATH”的环境变量定义,请使用如下命令编辑配置文件,

vim /etc/rstudio/rserver.conf

加入如下配置,

# Server Configuration File
rsession-which-r=/opt/R/4.1.2/lib/R
rsession-ld-library-path=/usr/java/jdk1.8.0_121/lib:/usr/java/jdk1.8.0_121/jre/lib

以上参数的意义,
“rsession-which-r”声明R的家目录位置(适用于安装多个版本的R中指定一个特定版本)
“rsession-ld-library-path”声明R需要调用的其他库文件的位置(范例声明Java库文件的位置)
====================
官方站点
————-
https://github.com/rstudio/rstudio
https://www.rstudio.com/

产品列表
————
https://www.rstudio.com/products/rstudio/#rstudio-server
https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552306-Getting-Started

软件的下载
————-
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/

安装R
—————
https://docs.rstudio.com/resources/install-r/

RStudio配置文件
—————-
https://docs.rstudio.com/ide/server-pro/r_sessions/r_executable_and_libraries.html
https://github.com/jjallaire/rsp-admin-guide/blob/master/05-r-sessions.Rmd

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